События разворачиваются в постапокалиптической Америке после вспышки мутации грибка кордицепса, превращающего людей в агрессивных заражённых. 

В первые дни пандемии Джоэл теряет свою дочь, что оставляет в нём глубокую травму.

Спустя 20 лет он работает контрабандистом в карантинной зоне Бостона. Ему поручают важную миссию — доставить 14-летнюю девочку Элли через опасную территорию. Элли — особенная, она обладает иммунитетом к инфекции, и учёные надеются создать на её основе вакцину.

Во время долгого и опасного пути Джоэл и Элли проходят через разрушенные города, сталкиваются с заражёнными, бандитами и другими выжившими. Постепенно между ними формируется сильная эмоциональная связь, напоминающая отношения отца и дочери.

В финале сезона выясняется, что для получения вакцины Элли должна погибнуть. Джоэл не может с этим смириться, спасает девочку и убивает тех, кто хотел её использовать. Элли остаётся в неведении, а Джоэл лжёт ей о том, что вакцину так и не удалось создать.

Сезон поднимает темы утраты, любви, жертвенности и морального выбора в условиях разрушающегося мира.