Со следующего сезона клуб и получил одноименное с городом название. За прошедшие с того момента недолгие 11 лет ФК «Атырау» знал и взлеты, и падения. Уже в первые два сезона в сильнейшем дивизионе чемпионата Казахстана атыраусцы дважды завоевывали серебряные медали турнира, что для дебютанта казалось невероятным успехом. Однако дальше все пошло по нисходящей — 4 место, 5-е, 10-е, дважды подряд — 14-е, 15-е… Хорошо еще, что в 2006/2008 годах в тогда еще Суперлиге (с 2008-го — Премьер-Лиге) чемпионата РК выступало 16 команд, и место в дивизионе за атыраусцами было сохранено. Потом, казалось бы, дело пошло на поправку — дважды в чемпионате страны «Атырау» финишировал шестым, завоевав к тому же в 2009-м Кубок Казахстана. Однако завершившийся чемпионат страны атыраусцы провели очень слабо.

Причин тому можно найти немало, но главной, наверное, стало не совсем обдуманное приглашение в межсезонье тренерской бригады из Азербайджана с Рамизом Мамедовым во главе. Пришедшие наставники не знали нашего футбола, его закулисья, не были знакомы с игровыми и человеческими качествами футболистов, игравших за «Атырау» прежде, однако активно начали от них освобождаться. Сначала локальные успехи команды чередовались с более частыми неудачами, многим казалось, что футболисты в коллектив пришли достаточно мастеровитые, и команда скоро заиграет. Но когда окончательно стало понятно, что кавалерийским наскоком чемпионат Казахстана не возьмешь, трудиться здесь нужно более основательно, кропотливо, подчас — самоотверженно, а последние шансы попасть в первую шестерку тают с большой скоростью, азербайджанцы попросились в отставку. Команду решено было доверить воспитаннику местного футбола Ивану Азовскому. Однако дела у отечественного специалиста сразу особо на лад не пошли. Перед «Атырау» всерьез замаячила перспектива распрощаться с Премьер-Лигой. И тогда на помощь был призван сербский специалист Зоран Филипович, тренер достаточно умелый и опытный.

Со своей задачей остаться в сильнейшем дивизионе чемпионата Казахстана «Атырау», в конце концов, справился, но от вылета из КПЛ был буквально на волоске. Помог в том западно-казахстанцам «Кайрат», в последнем туре не сумевший на своем поле переиграть «Тараз». Интересно, что сами атыраусцы для своего спасения в заключительный день чемпионата не сделали ничего, уступив в Кызылорде…

Вряд ли подобная ситуация удивительна. В далеко не самом бедном клубе страны за сезон сменилось три наставника, в основном составе коллектива в чемпионате страны на поле выходили 34 футболиста — фактически, составы двух команд вместе с запасными. Или трех — без оных. Футболисты просто не успевали привыкать к требованиям меняющихся наставников, в итоге качественная игра, как таковая, демонстрировалась атыраусцами крайне редко. А о том, что селекционная работа была проведена в межсезонье очень слабо, свидетельствует тот факт, что в летнюю дозавочную кампанию основной состав «Атырау» пополнили аж 8 (!) новых игроков…

К счастью для атырауских болельщиков, все эти проблемы для их команды, дай Бог, уже позади. Костяк у коллектива на финише сезона-2011 проглядывался. Необходимо теперь укрепить слабые позиции, побыстрее определиться с тем, кто будет главным тренером команды, и двигаться вперед.

В чемпионате Казахстана-2011 цвета «Атырау» защищали:

Андрей Шабанов (1986) — 32 (- 41, 2 с пенальти), Сергей Шафф (1988) — 28–4 (2 с пенальти), Андрей Травин (1979) — 28–2, Нивалдо (1985, Бразилия) — 28–1, Валентин Чуреев (1986) — 27–2 (1), Киран Бекхан (1982, Голландия)- 24–1, Рамиль Акбаров (1987) — 22, Константин Алейников (1987) — 18–3, Хавьер Леон (1982, Аргентина) — 17–1, Тельман Зунунов (1989) — 17, Сергей Куцов (1977) — 17, Денис Родионов (1985) — 15–2, Сильвано Комвалиус (1987, Голландия) — 15–1, Джонатас (1985, Бразилия) — 14–1, Бауыржан Джолчиев (1990) — 13, Бейбит Татишев (1984) — 13, Владимир Яковлев (1984) — 13, Тарас Данилюк (1984) — 12–5, Данияр Муканов (1976) — 12–1, Владимир Седельников (1991) — 12–1, Огбонна Ибезито (Зито) (1983, Нигерия) — 11–2, Боян Тркуля (1982, Сербия) — 10, Бауыржан Байтана (1992) — 9, Олег Сабиров (1981) — 9, Санат Шалекенов (1989) — 8, Абзал Жумабаев (1986) — 4, Денис Володин (1982) — 3, Айбар Нурыбеков (1992) — 3, Асылбек Сейткалиев (1992) — 3, Даурен Кайраллиев (1992) — 2, Анатолий Малков (1981) — 2, Иван Сивожелезов (1985) — 1 (- 2), Бакыт Абуов (1989) — 1, Садибек Тажимуратов (1990) — 1. 1 мяч в свои ворота провел Азат Нургалиев («Ордабасы»)

Ушли по ходу сезона: Б. Джолчиев («Тобол»), В. Яковлев («Тараз»), А. Малков («Кайсар»), Джонатас, Зито, Б. Абуов

Пришли по ходу сезона: В. Седельников («Восток»), С. Комвалиус («Аль-Салмия», Кувейт), Д. Муканов («Актобе»), Б. Байтана («Тараз»), С. Шалекенов («Акжайык»), Б. Тркуля, О. Сабиров, Т. Данилюк

Карточками наказывались:

Красными: Джонатас, К. Бекхан, В. Чуреев, Х. Леон, А. Травин — по 1

Желтыми: А. Травин — 11, Х. Леон, Нивалд0 — по 8, Б. Джолчиев, К. Бекхан, Б. Тркуля — по 6, Джонатас, В. Яковлев, Д. Родионов, Д. Муканов — по 4, Р. Акбаров, С. Шафф, В. Чуреев по 3, Зито, С. Куцов, Б. Татишев, В. Седельников — по 2, О. Сабиров, К. Алейников, А. Шабанов, Т. Зунунов, С. Шалекенов — по 1